Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1BQ13112 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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