Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TRAF1Q13077 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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TRAF1Q13077 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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