Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
EPHB4P54760 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
EPHB4P54760 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
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