Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
SMTNP53814 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms