Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PGGT1BP53609 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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