Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms