Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms