Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms