Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms