Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CIPCQ9C0C6 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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