Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP221-201ENST00000411271 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL590559.1-201ENST00000414338 374 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 E2F4P1-201ENST00000422443 1133 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3P7-201ENST00000428328 914 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HLA-T-206ENST00000429813 450 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC008267.4-201ENST00000442005 521 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SL748P-201ENST00000483066 311 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PAX8-211ENST00000497038 816 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 JRKL-AS1-201ENST00000511243 426 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNU1-125P-201ENST00000516752 129 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC027698.1-201ENST00000518536 625 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TCEA1-204ENST00000518784 586 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC022796.1-202ENST00000531882 477 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC138907.5-201ENST00000561744 273 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CDRT15P1-201ENST00000577632 564 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC004147.5-201ENST00000581727 536 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC005828.4-201ENST00000584608 552 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC063977.4-201ENST00000595913 872 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GLTP-206ENST00000617457 969 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GSG1-202ENST00000351606 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 HAVCR1-205ENST00000523175 1449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 BPIFA1-201ENST00000354297 1079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 IGHV1-46-201ENST00000390622 655 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms