Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC023141.10-201ENST00000415634 200 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 TAAR3P-201ENST00000466706 1078 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 CYB5A-204ENST00000494131 776 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC8.4□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP80-201ENST00000495605 424 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
CSPP1Q1MSJ5 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms