Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 ZNF85-206ENST00000596476 1259 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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