Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms