Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ALCAMQ13740 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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