Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 424.2 ms