Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LMAN2Q12907 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LMAN2Q12907 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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