Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 NFAT5-208ENST00000566899 4914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BPTFQ12830 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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BPTFQ12830 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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BPTFQ12830 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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