Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms