Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
USP18Q9UMW8 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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