Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GULP1-205ENST00000409805 983 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL4P5-201ENST00000413888 1276 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092580.2-201ENST00000414654 469 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TRIM26BP-206ENST00000427723 753 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TULP3P1-201ENST00000442322 816 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MIR3681HG-207ENST00000451644 623 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SL120P-201ENST00000463924 296 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092807.3-202ENST00000498304 508 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02056-203ENST00000512573 594 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 IGHVII-30-1-201ENST00000522218 301 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLC16A7-209ENST00000549465 537 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC055716.1-201ENST00000550077 495 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINGO1-AS1-202ENST00000558887 1124 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SNHG19-201ENST00000563192 342 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC002551.1-201ENST00000569881 592 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 BSNDP2-201ENST00000621945 366 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC010335.2-201ENST00000623166 528 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.208-201ENST00000629083 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC135068.10-201ENST00000638015 913 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GRXCR2-202ENST00000639411 837 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 FAM166B-207ENST00000639789 651 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00598-208ENST00000617777 2551 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 SCGB1D2-201ENST00000244926 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 OR10V1-201ENST00000307552 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP74-201ENST00000363538 109 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 CFAP61-207ENST00000389656 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 VN2R17P-201ENST00000391712 832 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD39Q53RE8 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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