Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDKN3Q16667 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms