Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SIX1Q15475 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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