Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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