Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTCH1Q13635 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PTCH1Q13635 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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