Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXE3Q13461 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms