Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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