Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CEP290O15078 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CEP290O15078 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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CEP290O15078 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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CEP290O15078 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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CEP290O15078 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CEP290O15078 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CEP290O15078 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CEP290O15078 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CEP290O15078 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CEP290O15078 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CEP290O15078 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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