Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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COL24A1Q17RW2 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
COL24A1Q17RW2 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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