Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NDUFA9Q16795 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.4 ms