Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDKN3Q16667 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms