Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms