Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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BRD3Q15059 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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