Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
R3HDM1Q15032 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms