| RUNX3 | Q13761 | AL807761.1-201 | ENST00000417622 | 171 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01945-201 | ENST00000419784 | 840 nt | TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OXSM-202 | ENST00000420173 | 1256 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451047.1-201 | ENST00000424451 | 814 nt | TSL 3 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008072.1-201 | ENST00000434254 | 824 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NDUFB4P8-201 | ENST00000435351 | 367 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BX679664.2-201 | ENST00000439282 | 283 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161621.1-201 | ENST00000444796 | 340 nt | TSL 3 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GYG1P1-201 | ENST00000460864 | 698 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AADACP1-204 | ENST00000483636 | 1285 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022133.1-201 | ENST00000490961 | 571 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091180.4-201 | ENST00000511322 | 245 nt | TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02223-202 | ENST00000511596 | 578 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097515.1-201 | ENST00000512370 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC064807.2-201 | ENST00000521188 | 672 nt | TSL 3 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068672.2-201 | ENST00000524022 | 336 nt | TSL 3 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021006.3-201 | ENST00000530771 | 192 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR7E128P-201 | ENST00000532736 | 1024 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC137768.1-201 | ENST00000549998 | 553 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4330-201 | ENST00000579077 | 105 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005828.3-201 | ENST00000583552 | 591 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005757.1-201 | ENST00000591432 | 472 nt | TSL 4 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092364.1-202 | ENST00000593824 | 565 nt | TSL 4 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005131.7-201 | ENST00000610087 | 611 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC239809.3-208 | ENST00000611452 | 531 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCBP1-AS1-278 | ENST00000625518 | 864 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNMT-202 | ENST00000383314 | 6250 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001157.1-201 | ENST00000550837 | 2339 nt | BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF518B-201 | ENST00000326756 | 6894 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NKAIN2-204 | ENST00000545433 | 3052 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEK-205 | ENST00000615002 | 4666 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PATE4-201 | ENST00000457514 | 1983 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POSTN-204 | ENST00000379749 | 3210 nt | TSL 5 BASIC | 5.31 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VWC2L-201 | ENST00000312504 | 4610 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009962.1-201 | ENST00000567327 | 3813 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHC3-203 | ENST00000467570 | 2595 nt | TSL 2 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRCAM-202 | ENST00000379022 | 3900 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OPRM1-215 | ENST00000520708 | 1519 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF615-213 | ENST00000602063 | 4094 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GNAS-202 | ENST00000306090 | 477 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP428-201 | ENST00000365129 | 132 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C1orf54-202 | ENST00000369099 | 600 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAPDHP15-201 | ENST00000398586 | 975 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00463-201 | ENST00000413501 | 1147 nt | TSL 3 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012368.2-201 | ENST00000423539 | 560 nt | TSL 3 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MGAT2P2-201 | ENST00000427194 | 797 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354794.1-201 | ENST00000442103 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL34P20-201 | ENST00000442771 | 351 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL138767.2-201 | ENST00000446794 | 168 nt | TSL 3 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC048351.1-202 | ENST00000449483 | 735 nt | TSL 3 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006463.2-201 | ENST00000473326 | 348 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COX6B1P5-201 | ENST00000509843 | 249 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL671862.1-201 | ENST00000515851 | 349 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103853.1-201 | ENST00000520588 | 649 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022360.1-201 | ENST00000521058 | 340 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073023.1-201 | ENST00000522896 | 773 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC022616.2-201 | ENST00000523185 | 300 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4A6P-201 | ENST00000534364 | 970 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRR4-212 | ENST00000544994 | 326 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009117.1-201 | ENST00000563948 | 554 nt | BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090617.5-201 | ENST00000571815 | 528 nt | TSL 3 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC044839.1-205 | ENST00000614989 | 542 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL033384.1-202 | ENST00000431554 | 3104 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VPS13B-203 | ENST00000358544 | 14094 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158066.1-201 | ENST00000451298 | 3796 nt | TSL 2 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETDB2-205 | ENST00000611815 | 5313 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC1A3-201 | ENST00000265113 | 4170 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RYR3-209 | ENST00000634418 | 15078 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZEB1-208 | ENST00000542815 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF1-214 | ENST00000612258 | 3805 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGF1-215 | ENST00000619447 | 3818 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ETV1-208 | ENST00000420159 | 6231 nt | TSL 2 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SOX2-OT-218 | ENST00000498731 | 3576 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STK3-216 | ENST00000523601 | 3107 nt | TSL 2 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DCLK1-204 | ENST00000379893 | 4612 nt | TSL 2 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138409.2-201 | ENST00000514048 | 5001 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00598-206 | ENST00000615947 | 3541 nt | TSL 4 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUP107-202 | ENST00000378905 | 2859 nt | TSL 5 BASIC | 5.3 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLFN5-201 | ENST00000299977 | 10591 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FCRL5-202 | ENST00000368189 | 4424 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRDE2-201 | ENST00000354366 | 14208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MOCS2-203 | ENST00000450852 | 1337 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAPPC13-201 | ENST00000231526 | 2715 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DNTTIP2-202 | ENST00000436063 | 5897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIF16B-202 | ENST00000355755 | 606 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP153-201 | ENST00000365026 | 316 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFAP126-201 | ENST00000367974 | 774 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451142.1-201 | ENST00000375867 | 775 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRAJ25-201 | ENST00000390512 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z97832.1-201 | ENST00000402490 | 328 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002530.1-201 | ENST00000405705 | 684 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451042.1-201 | ENST00000426353 | 544 nt | TSL 3 BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124944.2-201 | ENST00000429866 | 1242 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099677.4-201 | ENST00000446786 | 380 nt | TSL 3 BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL189P-201 | ENST00000468631 | 289 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093890.1-201 | ENST00000502554 | 540 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098799.1-201 | ENST00000504752 | 800 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BTF3P13-201 | ENST00000513224 | 490 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HMGN1P9-201 | ENST00000515212 | 298 nt | BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC062004.1-201 | ENST00000518706 | 686 nt | TSL 3 BASIC | 5.29 | □□□□□ -1.56 | | |