Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL1Q13616 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms