Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
IFT88Q13099 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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IFT88Q13099 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
IFT88Q13099 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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