Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTP4A2Q12974 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTP4A2Q12974 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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