Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TMPOP42166 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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