Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SFTPDP35247 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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