Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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SCN2BO60939 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SCN2BO60939 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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