Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms