Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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USP35Q9P2H5 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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USP35Q9P2H5 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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USP35Q9P2H5 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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USP35Q9P2H5 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
USP35Q9P2H5 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP35Q9P2H5 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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