Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC142Q17RM4 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC142Q17RM4 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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