Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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VPS72Q15906 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VPS72Q15906 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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