Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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CHD4Q14839 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHD4Q14839 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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