Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 SMCO2-201ENST00000298876 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 CST11-201ENST00000377007 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 SMCO2-202ENST00000416383 1272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AL359502.1-201ENST00000437334 692 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 ADAM3A-206ENST00000484602 1046 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LINC02428-203ENST00000513793 438 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 TTC23L-208ENST00000610313 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
NBR1Q14596 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 OCM-201ENST00000242104 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 TRBV5-1-201ENST00000390381 652 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 SPRY4-AS1-201ENST00000414314 521 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC023669.1-201ENST00000414915 524 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC002366.1-201ENST00000446186 1190 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 ELOBP1-201ENST00000447693 357 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AL356311.1-201ENST00000451697 258 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 VN1R6P-201ENST00000458417 907 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
NBR1Q14596 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms