Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
HTR4Q13639 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms