Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GPS1Q13098 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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