Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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FOXD4Q12950 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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